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福建医科大学创建于1937年，前身是福建省立医学专科学校，首任校长侯宗濂(1900年-1992年)，系中国近现代著名生理学家和医学教育家。经过78年的建设发展，学校已形成学士、硕士、博士人才培养体系和“勤奋、严谨、求实、创新”优良校风，成为一所集教学、科研、医疗、预防和社会服务为一体的省属医科大学。

2003年，福建省人民政府确定我校为省属重点建设高校。近年来，学校先后被评为“全国教育系统抗震救灾先进集体”、福建省党建和思想政治工作先进高校、省文明学校、省“依法治校”示范校、省“校务公开”示范校、省计划生育先进单位、省卫生先进单位、省绿化模范单位和省级花园式单位等。

学校拥有良好的科研条件，现有临床医学和基础医学2个博士后科研流动站，2个院士工作站。拥有肿瘤免疫药物开发国家地方联合工程研究中心，福建省创新抗体药物技术重大研发平台，福建省唯一的新药安全性评价中心，构建了完整的创新药物研发链。