本专业是我校重点发展的具有多学科交叉特色的专业，特色鲜明，发展前景广阔，现为江苏省特色本科专业建设点。
专业方向有现代生物医学仪器、生物医学光子学、生物医学信息学。
本专业注重培养学生具有扎实的生物医学、信息处理、计算机的理论基础，具备一定的医疗仪器开发能力、生物医学信息处理技术、电子计算机应用技术等方面的能力。
主要专业课程：生物医学仪器，医学生物物理学，生物医学信号处理，生物信息学，医学图像处理，医学成像技术，生理解剖学，普通生物学，生物医学传感器等。
毕业生可以在科研院所、企事业单位以及各级医院从事与生物医学工程、医疗仪器相关的科学研究、教学、技术开发和管理等工作。
该专业毕业生近三年升学率保持在30%以上，就业率均在99%以上。
近年来主要就业单位有上海西门子医疗器械有限公司、通用电气医疗系统（中国）有限公司、深圳迈瑞生物医疗电子有限公司、南京市鼓楼医院设备科、艾康生物技术（杭州）有限公司、沈阳东软数字医疗系统股份有限公司、南京柯美医疗器械有限公司等。