水利水电工程专业创建于1952年，具有50多年的办学历史，是我国同类专业中建立最早、培养学生最多的专业。
该专业创建初期为河川枢纽与水电站水工建筑专业，以后先后改名为水利水电工程建筑专业和水利水电建筑工程专业。
1998年根据教育部新的专业目录规定，调整为水利水电工程专业。
目前的水利水电工程专业涵盖了水利水电枢纽及河道整治的勘测、规划、设计、施工、监理、运行及管理等领域，并进一步向水资源规划、工程建设监理、安全管理等宽知识面和加强能力培养方面拓展。
本专业2002年被评为河海大学品牌专业，2003年被评为江苏省品牌专业。
主要课程高等数学、大学英语、大学物理、理论力学、材料力学、结构力学、水力学、土力学、工程地质（含水文地质）、工程测量、工程水文学、工程经济学、工程材料、钢筋混凝土结构、钢结构和工程项目管理、水资源规划及利用、水工建筑物、水电站、工程施工。
学生继续深造方向本专业可在水利、土木等学科继续攻读研究生。
学生就业情况学生就业状况一直保持供不应求的良好势头，多年供需比在1:3以上，其中在国家级设计院以及各省（自治区、市）设计院的毕业生达就业人数的15%，到各省（自治区、市）水利行政、管理部门、各流域水电开发公司和水电投资公司就业的人数达总就业人数的35%。